中印第二次反恐磋商于2003年6月13日在北京举行。双方代表团分别包括外交部和其他相关部门的代表。

　　双方主要就国际和地区反恐形势、双边反恐交流与合作、联合国在国际反恐合作中的作用、加强反恐能力建设等问题交换了看法。双方强调联合国应在国际反恐合作中起重要作用，愿为此加强多、双边反恐合作。双方同意明年上半年在印度进行第三次对话。

　　印方代表团还拜会了中国外交部部长助理沈国放。沈国放强调加强中印双边关系的重要性，积极评价两国的反恐磋商，认为这将有助于两国合作进一步向前发展，并相信此次磋商有助于瓦杰帕伊即将对中国进行的正式访问的准备工作。

　　中印两国于去年1月设立了反恐对话机制并于当年4月在印新德里举行了首轮对话。

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